以下回答いたします。
>Q1.各CLKOUT間で位相ズレは発生しないという認識で問題ないか?
(回答)
Skewがございます。
データシートP19の|Tskew|がそれにあたりTyp 50psです。
http://www.tij.co.jp/jp/lit/ds/symlink/lmk04828.pdf
>Q2.設定情報での構成で発生しうるクロック間の最大スキュー値
(回答)
申し訳ないことに最大値(全温度範囲)については規定がございません。
25度においては最大が50psとなります。
>Q3.LMK04828Bで生成したクリーンクロックをFPGAに取り込むことを
> 考えているが、デバイスの仕様をみるとLMK04828Bを初期化するMCU
> がないと出来ないように解釈したがその認識で問題ないか?
(回答)
はい。本ICは内部レジスタを設定することで様々な周波数を設定できるICです。
システム起動時にMCU等でLMK04828の内部レジスタを設定する必要がございます。
Best regards,
Kevin